一、染色体异常染色体异常包括染色体数目异常，如单体、三体、多倍体；结构异常，如断裂、缺失、易位均可致自然流产。

　　有人对自然流产和治疗性流产进行染色体的研究，发现在自然流产中核型异常者占60%，核型异常者每伴有胎儿或胎盘等一种结构上的异常。而核型正常者自然流产的胎儿多正常。

　　二、内分泌失调雌激素过多与孕酮不足亦为早期自然流产的原因。因在妊娠12～14周，易有内分泌失调尤其是黄体功能不足。

　　此外，甲状腺素缺少使细胞的氧化过程遭受障碍，以及甲状腺机能亢进与糖尿病等皆易发生自然流产。

　　三、胎盘异常与胎盘内分泌不足早期妊娠时的胎膜炎可使底胎膜出血或增生，绒毛内血管阻塞，影响营养物质的吸收与运送，以致孕卵从附着处分离、出血而自然流产。

　　此外如胎盘内巨大梗塞，可使胎盘功能降低，影响胎儿生存；而前置胎盘、胎盘绒毛水肿变性致成自然流产者亦不少见。

　　妊娠后母血中β-hCG、hPL、PE2雌酮，早孕时如这些激素值下降，则50%自然流产。

　　四、血型不合由于以往妊娠或输血，致Rh因子、不合的ABO血型因子在母体中产生抗体，此次妊娠由胎盘进入胎儿体内，与红细胞凝集而产生溶血，以致自然流产。

　　五、精神神经因素如惊吓、严重精神刺激等，也都可致成自然流产。近年来通过研究认为噪音与振动对人的生殖有一定影响。

　　六、母体全身性疾病（一）严重的急性传染病和感染疾病：

　　如大叶性肺炎多伴发生高热，导致子宫收缩，或胚胎死亡，均可致自然流产。

　　（二）慢性疾病：

　　严重贫血、心脏病、心力衰竭可引起胎儿缺氧、窒息而死亡；慢性肾炎、严重高血压可使胎盘发生梗死或早剥离，而引起自然流产。

　　（三）营养不良或药物中毒：

　　如维生素缺乏特别是维生素E—生育醇的缺乏，汞、铅酒精及吗啡等慢性中毒，均可引起自然流产。

　　七、生殖器官疾病子宫畸形，如双角子宫、子宫腔纵隔常为自然流产的原因。

　　此外如子宫肌瘤，尤其是向子宫腔内发展的粘膜下肌瘤或嵌顿在盆腔中的卵巢囊瘤，均可影响胎儿的发育，而导致自然流产。

　　子宫内口松弛为习惯性自然流产常见原因之一。

　　近年来发现宫腔粘连患者中，约14%发生在自然流产。因粘连引起宫腔缩小、变形和子宫内膜面积减少，影响胚胎发育。

　　八、免疫因素对原因不明者，近年来研究发现多数与免疫因素密切相关。

　　（一）组织相容抗原：

　　正常妊娠时夫妇组织相容抗原不相容，可维持遗传的多样性。而习惯性自然流产夫妇间组织相容抗原相容的频率大于正常妊娠者。母体免疫系统易对胎儿产生免疫学攻击而导致自然流产。

　　（二）抗磷脂抗体：

　　近年来研究发现，在自身免疫性疾病，某些感染、药物，或不明原因的疾患中如抗磷脂抗体阳性，习惯性自然流产发生率极高。

　　（三）抗精子抗体：

　　在反复自然流产夫妇中，研究发现双方或男方血清中的抗精子抗体。

　　抗精子抗体引起的自然流产，多发生在3个月以内的早期自然流产。